Нельзя подписывать контракт на бумажном носителе, если победитель определялся в ходе электронного аукциона.

Это не предусмотрено Законом о Контрактной системе № 44-ФЗ. А, следовательно, заказчик не в праве требовать, чтобы по итогам электронного аукциона контракт одновременно подписывался в электронной и бумажной формах.

Если же заказчику либо исполнителю в каких-то целях требуется контракт на бумажном носителе, то закон не запрещает сделать бумажную копию контракта, заверив ее установленным образом.

Такие разъяснения дал Департамент развития контрактной системы Минэкономразвития России (Письмо Минэкономразвития России от 30.12.2015 N ОГ-Д28-16594)